Долгосрочное употребление мескалина может привести к нескольким серьезным проблемам, связанным с психическим здоровьем. Одно из состояний, вызванных долгосрочным употреблением галлюциногенов называется «флэшбек». При возникновении флэшбека, человек невольно вводится в состояние воздействия галлюциногенов, без их предварительного употребления.

Долгосрочное употребление галлюциногенов может также привести к состоянию, известному как персистирующий или вызванный наркотиками психоз. Это происходит, когда люди, употребляющие галлюциногены впадают в состояние, напоминающее психоз. Это может проявляться в виде тяжелой депрессии, резких перемен настроения и искаженного восприятия окружающего мира. Эти симптомы могут проявляться на протяжении нескольких лет, и возникать у людей, которые не имеют предыдущей истории психических заболеваний.